TreeThreader Calls for more Computing Power
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wenjing wu
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Message 1046 - Posted: 30 Apr 2013, 14:49:58 UTC

TreeThreader application(software for protein structure prediction) recently has 50K new sequences for prediction, with each sequece requires around 85 CPU hours computation time,this equals to a 4.25M CPU hours computing time. Because of the limitation of the Job Submission system, new jobs are not generated continously on the server side. To solve this problem, we are trying to tighten the deadline, increase replication number, and increase the parallelism on the Job Submission end so that volunteer hosts can receive more new jobs!

TreeThreader近期有大约5万条序列需要进行结构预测,每条序列大约平均需要85个CPU小时的处理时间,因此估计大约总计需要425万个CPU小时才能完成这批任务,请各位志愿者积极支持TreeThreader!由于TreeThreader前端作业提交服务系统的限制,新作业并非是源源不断产生的,我们将采取通过缩短deadline,加大replication数目,增加前端并行能力,尽量使得志愿主机取得更多的作业。
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加油!CAS@home!我们帮助科学家跟时间赛跑!
Go CAS@home! We help scientists to race against time!

mbh
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Message 1047 - Posted: 30 Apr 2013, 15:04:17 UTC

今天收到了这个项目的一个任务,结果不小心删除了,郁闷。
我今天的任务怎么剩余时间都在增加呢,前几天的时候都是1个半小时就搞定的,今天有一个5个小时了,还没搞定,不知道为什么

Val Yu
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Message 1048 - Posted: 1 May 2013, 3:46:39 UTC - in response to Message 1046.

我加了很多项目,要是能设置项目优先级的话,我可以把CAS设为优先

kinght0
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Message 1049 - Posted: 1 May 2013, 4:35:17 UTC

oh yeah,火力全开

Richard
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Message 1050 - Posted: 1 May 2013, 16:04:48 UTC - in response to Message 1048.

在每个项目的用户账户里的社区设置里可以设置该项目在BONIC中的比重,类似于优先级

Val Yu
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Message 1053 - Posted: 2 May 2013, 3:39:11 UTC - in response to Message 1050.

你说的应该是资源分享值吧,不是在社区设置,是项目设置里,BAM上面也有。已经把CAS设为500了~

加佳钙
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Message 1055 - Posted: 2 May 2013, 5:04:44 UTC

火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。

____________

加佳钙
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Message 1056 - Posted: 2 May 2013, 15:40:51 UTC

现在已经 当前处理能力(GFLOPs) 916 加油 CAS@HOME

加佳钙
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Message 1058 - Posted: 3 May 2013, 11:05:38 UTC - in response to Message 1056.

准备入手两个 L5520 U,再淘点5500的主板,弄个8核心16线程的机器来算任务。
希望效果理想哈。省电,U多。呵呵

mbh
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Message 1059 - Posted: 3 May 2013, 17:41:47 UTC

最近好像无效结果比较多啊,192个结果,7个无效,有时候算了很久的,结果是无效结果,看着很郁闷啊。不知道是怎么回事。

mbh
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Message 1060 - Posted: 3 May 2013, 17:45:21 UTC - in response to Message 1049.

oh yeah,火力全开

哥们,你计算机也太多了吧。呵呵。

加佳钙
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Message 1061 - Posted: 3 May 2013, 18:38:28 UTC - in response to Message 1060.

oh yeah,火力全开


哥们,你计算机也太多了吧。呵呵。



这个也算多啊

加佳钙
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Message 1062 - Posted: 3 May 2013, 18:41:14 UTC - in response to Message 1055.

火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。



当前处理能力(GFLOPs) 989

加佳钙
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Message 1065 - Posted: 5 May 2013, 0:08:46 UTC - in response to Message 1062.



火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。

当前处理能力(GFLOPs) 989

当前处理能力(GFLOPs) 1,011 呵呵,过了第一大关了。

kinght0
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Message 1066 - Posted: 5 May 2013, 3:51:42 UTC - in response to Message 1061.

呵呵 在加佳钙的强大火力面前 小弟我不敢高调 话说这位仁兄应该是IT部门的吧?我最主要自己家里 空间问题导致智能堆笔记本 要采购台式机老婆意见很大

kinght0
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Message 1067 - Posted: 5 May 2013, 3:56:07 UTC - in response to Message 1065.



火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。

当前处理能力(GFLOPs) 989

当前处理能力(GFLOPs) 1,011 呵呵,过了第一大关了。


100TFLOPs 你是怎么达到的?可以用学校和企业机房?

加佳钙
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Message 1068 - Posted: 5 May 2013, 5:43:36 UTC - in response to Message 1067.





火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。

当前处理能力(GFLOPs) 989

当前处理能力(GFLOPs) 1,011 呵呵,过了第一大关了。

100TFLOPs 你是怎么达到的?可以用学校和企业机房?

这个, 哪个。。。。。嗯。。。。。。 啊
哎呦,人家说的是整个 Cas@home 的当前参与计算的CPU的当前计算能力。
http://casathome.ihep.ac.cn/server_status.php

这里可以看到
你以为我开超算中心的啊。
计算机也就比你多一点点,晚上算算,白天机器要服务哈。
不过测试下来,还是发现 I5 I7 3代的功率低,运算能力强。其他的cpu全速算,热啊一个。
还是有人说的对,想办法开发GPU浮点运算的程序,充分发挥显卡的浮点预算能力。



kinght0
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Message 1069 - Posted: 5 May 2013, 5:55:54 UTC - in response to Message 1068.





火力加强中ing,为CAS项目,加速。
呵呵,准备多换几个8核的处理器运行任务哈。
当前处理能力(GFLOPs) 881 向1000,2000,3000,5000,100000进军。
后期的任务规划好啊。

当前处理能力(GFLOPs) 989

当前处理能力(GFLOPs) 1,011 呵呵,过了第一大关了。

100TFLOPs 你是怎么达到的?可以用学校和企业机房?

这个, 哪个。。。。。嗯。。。。。。 啊
哎呦,人家说的是整个 Cas@home 的当前参与计算的CPU的当前计算能力。
http://casathome.ihep.ac.cn/server_status.php

这里可以看到
你以为我开超算中心的啊。
计算机也就比你多一点点,晚上算算,白天机器要服务哈。
不过测试下来,还是发现 I5 I7 3代的功率低,运算能力强。其他的cpu全速算,热啊一个。
还是有人说的对,想办法开发GPU浮点运算的程序,充分发挥显卡的浮点预算能力。




原来是这样,我是苦于没法采购台式机,笔记本只有一台i3的还行,3台老的实在性能散热都不给力,两台AMD 620的降压降频 风扇还是很吵,现在天热了更加要注意散热和噪音。

倒是GT430的显卡 给Folding@home 和 WCG HCC贡献了很多。等到CAS支持显卡了,我买显卡的预算还是有的。买整机,囊中羞涩。

kinght0
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Message 1070 - Posted: 5 May 2013, 6:03:00 UTC - in response to Message 1069.

不过本来 清华的机器都运作的 现在不知道为什么撤了。Boinc也除了andorid版本,不过手机和平板的运算远比不上GPU,还是等GPU快点开发吧。HCC项目我突然发现上周都没有任务了,一查才知道算完了,之前我CPU4小时算一个包,我GPU40分钟就ok

Val Yu
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Message 1071 - Posted: 5 May 2013, 13:19:39 UTC

最近参加那个五项赛了,等比赛结束全力投身CAS

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